В разные периоды времени работал научным сотрудником ГМИИ им. Пушкина, в отделе междисциплинарных программ ГЦСИ, преподавал курс теории современного искусства на кафедре кино и современного искусства РГГУ, участвовал в создании образовательных программ Школы Родченко, института «База» и Британской высшей школе дизайна.
До 2022 года преподавал в Московской школе новой литературы, продолжая одновременно развивать авторские курсы, посвящённые теории искусства, медиа и современным визуальным практикам. С 2023 года живёт и работает в Париже.
Лекции Бориса Клюшникова на YouTube